عنوان الإطروحه
Molecular Identification of Entamoeba Histolytica from Stool Samples collected from Jordanian Patients
تاريخ مناقشة الاطروحه
2019-05-06
اسم الطالب
ايلاف عادل عبدالهادي الدلابيح
المشرف
فوزي ارشيد يعقوب ارشيد
المشرف المشارك
اعضاء لجنة المناقشة
عبد الرحيم الحنيطي
عدنان سليم خليل جرن
تغلب محمد فاتح الذيب
الكلية
كلية العلوم
القسم
العلوم الحياتية
الملخص بالعربية
داء الأميبات هو عدوى طفيلية معروفة في الأمعاء الغليظة التي تسببها الانتاميبا هستوليتكا ، لايوجد الكثير من المعلومات عن اصابات الانتاميبا هستوليتكا في الاردن ، يعتمد اكتشاف وتحديد الانتاميبا هستوليتكا في الأردن بشكل أساسي على نتائج الفحص المجهري لعينات البراز. لذلك ، تهدف هذه الدراسة الحالية الى تحديد انواع الانتميبا من خلال عينات البراز التى تم الحصول عليها من المرضى المصابين بواسطة الفحص المجهري و فحص فحص المناعة المعتمد على الانزيم وفحص تفاعل البلمرة المتسلسل .وقد أجريت هذه الدراسة خلال الفترة من أغسطس 2017 إلى يوليو 2018. تم جمع 200 عينة من البراز من المرضى المحتمل اصابتهم ب داء الاميبات من ثلاثة مستشفيات مختلفة في شمال الاردن . تم فحص العينات بالفحص المجهري ، ثم فحص العينات بواسطة فحص المناعة المعتمد على الانزيم للكشف عن مستضدات الانتاميبا هستوليتكا . تم استخراج الحمض النووي من عينات البراز ، ثم تم فحص العينات بثلاثة انواع من فحص تفاعل البلمرة المتسلسل للتميز بين انواع الانتاميبا. استند تحديد الأولي لداء الأميبات على وجود أعراض سريرية. وتشمل هذه التشنجات الخفيفة أو الشديدة في البطن والإسهال أكثر من ثلاث مرات في اليوم. وفقًا للفحص المجهري الأولي الذي تم إجراؤه داخل المستشفى ، تم تشخيص 100 حالة من أصل 200 حالة بداء الأميبا. كشفت الجولة الثانية من الفحص المجهري أن 35 ? (70/200) من العينات تم اختبارها إيجابية لأنواع الانتاميبا. كانت جميع العينات(70) التي كانت إيجابية عن طريق الفحص المجهري سلبية في الفحص المناعة المعتمد على الانزيم وفحص تفاعل البلمرة المتسلسل . أظهرت البيانات الناتجة أن الأطفال هم الفئة العمرية الأكثر تضرراً ، يليهم المراهقون والبالغون. كان معدل الإصابة بداء الاميبات أعلى مرتين في الذكور من الإناث. وقد لوحظت أعلى نسبة إصابة بالتهاب الانتاميبا في موسم الصيف ، يليها الربيع والخريف. تم العثور على أعلى معدل للإصابة بالتهاب الانتاميبا في منطقة إربد ، يليها منطقة الرمثا ثم في منطقة المفرق. تم العثور على أقل معدل للإصابة بالتهاب الانتاميبا في منطقة الزرقاء. كان عدد الحالات الإيجابية الانتاميبا في المناطق الريفية من المناطق الحضرية. في الختام ، كانت هذه الدراسة هي الدراسة الأولى التي استخدمت الأساليب القائمةعلى فحص تفاعل البلمرة المتسلسل كأداة جزيئية لتشخيص وتحديد عينات البراز التي تم جمعها من المرضى الأردنيين المصابين بداء الأميبا. علاوة على ذلك ، هناك بعض الأدلة من خلال الفحص المجهري على أن هذه العينات البراز فحص قد تحتوي على أنواع الانتاميبا. ومع ذلك ، فشل اختبار المناعة المعتمد على الانزيم وتفاعل البلمرة المتسلسل في اكتشاف وتحديد وجود الانتاميبا هستوليتكا في عينات البراز هذه. لذلك ، لا تزال هوية هذا النوع الجديد المحتمل من غير واضحة أو غير محددة. لتوضيح ما إذا كانت الأنواع الأخرى أو مسببات الأمراض الطفيلية التي قد تكون موجودة في عينات البراز من المرضى المصابين ، يوصى بشدة بإجراء دراسة جديدة لتحديد هوية هذا النوع.
الملخص بالانجليزي
Amebiasis is a well known parasitic infection of the large intestines that is caused by Entamoeba histolytica. The detection, identification and confirmation of Entamoeba histolytica in Jordan have been mainly based on the results of microscopic examination of fresh stool specimens. Therefore, this present investigation aimed to identify Entamoeba species from fresh stool specimens obtained from infected patients by microscopic, immune assay and polymers chain reaction (PCR). The present study was conducted during the period from August 2017 to July 2018. A total of 200 stool samples were collected from patients with suspected amebiasis from three different hospitals in northern part of Jordan. Stool samples were subjected to microscopic examination. An enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to detected E. histolytica specific antigens in Entamoeba species in aqueous extracts of human stool specimens. DNA was extracted from the stool sample. Then, conventional PCR, two conventional PCR (tRNA gen linked loci (SD and SQ)) and duplex real-time PCR (TaqMan1) were used to differentiate between E. histolytica, E. dispar, and E. moshkovskii. Initial identification of amebiasis was based on the presence of clinical symptoms. These include mild or severe abdominal cramping and diarrhea more than three times a day. Thus, the primary decision was based on the presence of some symptoms of amebiasis. According to the primary microscopic examination performed inside the hospital, 100 cases out of 200 cases were diagnosed with amebiasis. The second round of microscopic examination revealed that 35% (70/200) of specimens were tested positive for Entamoeba species. All 70 samples which were positive by microscopic examination were negative in the ELISA assay and PCR-based techniques for the presence of E. histolytica, E. dispar, or E. moshkovskii. Moreover, the resulting data revealed that children(2-12) were the most affected age group with E. histolytica, followed by adolescents(13-17) and adults(18-59) whereas older adult(> 60) were the lowst affected age group. The infection rate with E. histolytica was about twice as high in males than females. The highest infection rate of E. histolytica was seen in summer season, followed by spring and autumn whereas The lowst infection rate of E. histolytica was seen in winter season . The highest infection rate with E. histolytica was found in Irbid district, followed by Al-Ramtha district and then by Al-Mafraq district. The lowest infection rate with E. histolytica was found in AL-Zarqa district. The number of positive cases for E. histolytica were higher for rural area than urban area. In conclusion, this study was the first study that utilized PCR?based methods as molecular tool for diagnosis and identification of E. Histolytica in stool specimens collected from Jordanian patients with amebiasis. Moreover, there is some evidence by microscopic examination that these examined stool specimens might contain Entamoeba species. However, the ELISA test and PCR methods had failed to detect and identify the presence of Entamoeba species in these stool specimens. Therefore, the identity of this potential new species of Entamoeba remains unclear or undefined. To clarify whether other Entamoeba species or parasitic pathogens that might be present in these stool samples of the infected patients, it is highly recommended that a new study must be carried out to determine the identity of this Entamoeba species
رقم ISN
6417
للحصول على الرسالة كملف يرجى تزويد المكتبة برقم ISN