عنوان الإطروحه |
Isolation and Identification of Fungi from Soil and Plant Parts at Northern-Eastern Jordan Desert
|
تاريخ مناقشة الاطروحه |
2017-08-09 |
اسم الطالب |
بيان محمد ارشيد بني حسن
|
المشرف |
سهيل احمد قاسم السهيلي |
|
المشرف المشارك |
|
اعضاء لجنة المناقشة |
| عماد ابراهيم سليمان حسين |
| تغلب محمد فاتح الذيب |
| يعقوب حسن عيد يعقوب |
|
الكلية |
كلية العلوم |
القسم |
العلوم الحياتية |
الملخص بالعربية |
لا يزال تدهور وتلف محاصيل الخضروات والفاكهة التي تسببها الفطريات الخيطية مصدر قلق بالغ لأنها مصادر غذائية للمستهلكين و ذات أهمية اقتصادية كبيرة للمزارعين. ولحل هذه المشاكل الخطيرة، لا تزال هناك حاجة لعزل وتحديد الفطريات الخيطية للسيطرة عليها ومنع أضرارها للمحاصيل الزراعية. ولذلك، فإن هذه الدراسة تهدف إلى عزل وتحديد الفطريات الخيطية من مصادر بيئية مختلفة في شمال شرق الأردن. وجرى عزل الفطريات من التربة من خلال استخدام طريقة تخفيف التربة و على الجانب الآخر عزل الفطريات من أوراق الشجر والفواكه تم تنفيذها بعد ذلك تمت ملاحظة المستعمرات الفطرية والحفاظ عليها. وجرى تحديد الفطريات على مستوى الجنس من خلال استخدام فحوصات بالعين المجردة والمجهر اعتمادا على اللون والشكل والحجم والخيوط الفطرية، conidia، conidiophores وترتيب الأبواغ. وقد استخدمت التقنية الجزيئية لتحديد الفطريات المعزولة على مستوى الأنواع في خطوات متسلسلة بدءا من استخراج الحمض النووي باستخدام DNAeasy minikit ثم تم إرسال عينات الحمض النووي إلى مركز هيا الأميرة للتكنولوجيا الحيوية حيث تم تكثيرها من قبل
PCR باستخدام بادئ محدد ثم تمت مقارنة )BLASTالتتابعات التي تم الحصول عليها مع التتابعات الأخرى ذات الصلة في بنك الجينات (
وأظهرت نتائجنا أن Aspergillus niger كان الفطر الأكثر وفرة الذي تم الحصول عليه من جميع المواقع والموارد في حين أن Alternaria tenuissima كان أقل واحد. لاحظنا أيضا أن نوعين من Alternaria استعمرت أوراق النباتات في مواقع مختلفة و لذلك نستطيع فحص قدرة هذا الفطر في التسبب بالأمراض لهذا الجزء من النبات في المستقبل. تم عزل الأنواع التالية وتحديدها من جميع الموارد على الرغم من أنها معزولة من مواقع مختلفة:
Rhizopus stolonifer, Aspergillus tubingensis, and Fusarium oxysporum. يجب إجراء المزيد من الدراسات لفحص إمراضية هذه الفطريات الخيطية للنباتات أو البشر وكيفية الحد من توزيعها.
|
الملخص بالانجليزي |
The deterioration and spoilage of vegetable and fruit crops which caused by filamentous fungi remains an important concern because they are food sources for consumers and of great economic importance to farmers. To solve these serious problems, there is still a need for isolation and identification of filamentous fungi to control them and prevent their damage for agricultural crops. Therefore, this study aimed for isolation and identification of filamentous fungi from different environmental sources in northern eastern Jordan Desert. The isolation of fungi from soil was carried out using soil dilution method in addition to the isolation of fungi from leaves and fruits was implemented and the pure cultures were maintained. The identification of fungi at the genus level was carried out by using macroscopic and microscopic examinations depending on color, shape, size, hyphae, conidia, conidiophores and arrangement of spores. The molecular technique was used to identify the fungal isolates at the species level in serial steps starting with DNA extraction by using DNAeasy minikit then the DNA samples were sent to Princess Haya Biotechnology Center for 5.8S rRNA amplification by PCR where they used specific primer and for sequencing. The obtained sequences were compared with the other related sequences in GenBank by using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Our results showed that the Aspergillus niger was the most abundant fungus obtained from all locations and resources while the Alternaria tenuissima was the less abundant one. We also noticed that two Alternaria species were colonized the leaves of plants at different locations so we can screen the pathogenicity of this fungus for that part of plant in the future. The following species were isolated and identified from all sources although they isolated from different locations: Rhizopus stolonifer, Aspergillus tubingensis, and Fusarium oxysporum. Further studies must be carried out to examine the pathogenecity of these filamentous fungi for plants or humans and how to limit its distribution |
رقم ISN |
4713 |
|
للحصول على الرسالة كملف يرجى تزويد المكتبة برقم ISN
|
|